מיקרוסקופ הוא מכשיר המשמש להגדלה ויזואלית של עצמים הקטנים מכדי להיראות על ידנו.
ברפואה הווטרינרית נעשה שימוש רב במיקרוסקופ.
על מנת לבדוק עצם מסוים תחת מיקרוסקופ עלינו להכין משטח מיוחד, הדבר דורש מיומנות בהשגת העצם הרצוי וצביעתו של המשטח בכדי להתאימו לבדיקה תחת המיקרוסקופ. 
שימושים עיקריים של המיקרוסקופ במרפאתנו הם:
זיהוי של טפילי אוזניים
זיהוי של טפילי עור
זיהוי של אבנים או קריסטלים בדרכי השתן
בדיקה של חומר הנשאב מגידולים או מאסות שונות
זיהוי תאים לא נורמאלים במשטחי דם
ועוד.
